受到全球五合一疫苗(白喉、破傷風、非細胞性百日咳、b型嗜血桿菌及不活化小兒麻痺五合一疫苗)缺貨影響，衛福部於去(102)年7月起開始向各家廠商積極爭取貨源，但廠商目前仍未能確認可供貨的期程與數量；因此，若以目前現有庫存量及已完成採購的供應量核算，預估今年5至6月起國內五合一疫苗將陸續出現缺貨情形。
目前疾管署除了持續向廠商積極爭取貨源外，已於去年12月26日向衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組討論因應方式。由於五合一疫苗全程共需接種四劑，為保障嬰幼兒健康，會中決議前三劑基礎劑仍維持原接種時程，而原出生滿18個月接種的第四劑五合一疫苗，自即日起暫時調整接種年齡為27個月(2歲3個月)，直到疫苗供應正常為止。
疾管署特別呼籲，在此過渡期間，家中若有年滿18個月的幼兒，請於年滿27個月(2歲3個月)時，配合第三劑日本腦炎疫苗接種時程，再一起接種五合一疫苗第四劑，兩項疫苗可同時在不同部位接種。
事實上，根據美國文獻指出，接種過三劑基礎劑疫苗，約可增加70-90%的保護效力，且國際其他先進國家如英國、澳洲等，都建議在幼童3-4歲時，接種第四劑含百日咳疫苗。疾管署強調，日後將持續積極尋找貨源，把對幼兒健康的影響減到最低，請家長們放心。
