近代移植醫學的發展，除了幫助病患器官功能再造，也為病患及家屬的未來健康生活開創新的可能性，三軍總醫院身為醫學中心，亦為延續生命及改善生活品質，共同守護軍民的健康福祉為目標。在歷任軍醫局局長及院長指導下，於111年進一步成立移植醫學部，致力於打造全方位整合型移植醫療照護環境，研發醫療相關技術，提升移植成功率及生活品質，持續強化醫學訓練孕育優秀醫學人才，同時開拓國際移植醫療。
五臟皆可移植 三總醫學中心
自民國75年以來精進各臟器移植醫學技術，獲得衛服部核予多項肯定，包括：75年腎臟移植、77年心臟移植、88年角膜移植、90年肝臟移植、104年胰臟移植及111年肺臟移植，更通過成為臺灣北區五臟皆可移植之醫學中心。
三軍總醫院配合國家衛生及健康政策發展，成立器官捐贈暨移植作業審議會，推動器官捐贈宣導與移植業務，除了促進器官捐贈的資訊流通及接受，更積極整合院內各臨床、行政單位，齊心完成器官勸募移植之各項推動措施。隨著各項移植醫學知識及手術之成熟，成立移植外科(編制於外科部轄下)，專責研發精進各項移植技術。
臨床團隊整合 成立移植醫學部
隨著器官勸募移植業務類型日益擴增，為服務更多軍民，以及持續精進醫療品質，三軍總醫院將移植外科及各移植專業臨床團隊整合，成立移植醫學部，首任部長由陳登偉醫師擔任，凝聚部門首要發展共識及架構，包括：打造專屬移植病人之整合性移植醫療環境、設置移植免疫檢驗室、發展精進基礎免疫醫學研究及建立移植專責專職團隊，為移植醫學部奠定發展根基。
柯宏彥醫師接任部長推動移植專責病房設置，共計20床結合各項器官移植科室，如心臟血管外科(心臟移植)、一般外科(肝臟及胰臟移植)、泌尿外科(腎臟移植)及胸腔外科(肺臟移植)之專業，更可集中醫療資源提供移植患者更縝密的專業照護。為了撫慰及舒緩病患及家屬治療期間的不安定感，專責病房整體空間設計以舒適、安全感為主題，讓病房有家的感覺，幫助病患及家屬能安心穩定的接受醫療，獲得最有品質的移植照護。
